Дирекция „Финанси на общините” извършва дейностите по съставяне, изпълнение и приключване на консолидираната фискална програма в частта за общините.
След стартирането на процеса на финансова децентрализация през 2003 г., дейностите по организирането и предоставянето на публични услуги, финансирани чрез бюджетите на общините бяха разделени на делегирани от държавата и местни дейности. Финансирането на делегираните от държавата дейности във функциите: „Общи държавни служби”, „Отбрана и сигурност”, „Образование”, „Здравеопазване”, „Социално осигуряване, подпомагане и грижи”, „Почивно дело, култура, религиозни дейности” и „Икономически дейности и услуги” се извършва на базата на стандарти. Делението на дейностите и стандартите се актуализират ежегодно с Решение на Министерския съвет.
Дирекция „Финанси на общините” обработва, поддържа и анализира ежемесечните отчети за касовото изпълнение на бюджетите на общините, извънбюджетните им сметки, просрочените вземания и задължения и банковите наличности. Дирекцията анализира годишния отчет за касовото изпълнение на бюджетите на общините и извършва корекции на бюджетните взаимоотношения на общините с централния бюджет в изпълнение на нормативни актове.
Дирекцията разработва по общини разчети за числеността на персонала и средната месечна брутна заплата във функциите „Здравеопазване” и „Общи държавни служби”, дейност „Общинска администрация”. Разработва стандарти за финансиране на делегираните от държавата дейности, подготвя проекти на нормативни актове, касаещи бюджетния процес в общините и взаимоотношенията им с централния бюджет. Подпомага методологически общините по отношение законосъобразността и целесъобразността на извършваните разходи.
Координира работата по съставянето, изпълнението и приключването на общинските бюджети и дейностите по разработването на стратегии, програми и проекти на нормативни актове за осъществяване процеса на финансова децентрализация. Определя ежемесечно лимити за отпускане на обща допълваща субсидия, държавен трансфер на преотстъпения данък по Закона за данъците върху доходите на физическите лица, обща изравнителна субсидия, трансфер за компенсиране на приходи от отпадналия пътен данък и целева субсидия за капиталови разходи. Разработва механизъм за разпределение на изравнителната субсидия и на целевата субсидия за капиталови разходи на общините. Съгласува разчетите за финансиране на капиталовите разходи на общините, подлежащи на утвърждаване от министъра на финансите и определя ежемесечни лимити за отпускането им, включително и за основен ремонт и изграждане на местни общински пътища. Извършва мониторинг относно спазването на реда за предоставяне на средства на общините за съфинансиране на общински проекти по международни и национални програми (Социалноинвестиционен фонд, „Красива България”, ФАР и други). Изготвя отговори и становища относно прилагането на нормативната уредба, свързана с финансиране на делегираните от държавата и на местните дейности. Дава становища по законопроекти и по проекти на подзаконови нормативни актове, свързани с работата на местното самоуправление и местната администрация.
В изпълнение на Закона за общинските бюджети, координира и организира провеждането на консултации с Националното сдружение на общините в Република България.